Seit 2001 ist Prof. Dr. Jochen Bauerreis Dozent an der Universität von Straßburg. Er war insbesondere verantwortlich für den Studiengang „Magistère Juristes d’affaires Franco-Allemands“.
Prof. Dr. Jochen Bauerreis betreut darüber hinaus Promotionen in gemeinsamer Betreuung (thèses en co-tutelle) zwischen der Universität von Straßburg und der Universität von Freiburg i.Br.
Im Rahmen seiner universitären Tätigkeit hält Prof. Dr. Jochen Bauerreis regelmäßig die folgende Vorlesungen:

- Französisches Gerichtsverfassungsgesetz (Licence 1)
- Deutsches Zivilrecht (Licence 1)
- Vertiefungskurs Deutsches Recht I: Europarecht (Licence 3)
- Vertiefungskurs Deutsches Recht II: Gesellschaftsrecht – Arbeitsrecht (Licence 3)
- Gesellschaftsrecht aus rechtsvergleichender Sicht (Master 1)
- Internationales Wirtschaftsrecht (Master 2 Bank- und Kapitalmarktrecht)
- Internationales Schiedsverfahrensrecht (Master 2 Internationales Privatrecht
- Internationales und deutsch-französisches Wirtschaftsrecht (Ecole de Management)
- Deutsch-Französisches Steuerrecht (Ecole de Management)
- International and European Business – Import/Export (Ecole de Management)
- Transnational Business Law (Master 1)